Details about this organism
Synonyms (1)mouse <Mus musculus>
Definitions (0)
None defined
NCBI taxonomy browser
Strain details
Name | Provider name | Provider's strain ID | Genotypes | Phenotypes | Synonym | Comments | Based on |
---|
Related items
LiSyM-Krebs ist ein nationales Forschungsnetz zur Früherkennung und Prävention von Leberkrebs, das unter Verwendung des systemmedizinischen Forschungsansatzes die komplexen, dynamischen Prozesse der Krankheitsprogression analysiert, um ausgehend von den Erkenntnissen aus dem Forschungsnetz LiSyM die Entstehung von Leberkrebs besser zu verstehen, vorherzusagen und im besten Fall sogar zu verhindern. LiSyM-Krebs setzt die erfolgreichen Forschungsaktivitäten der BMBF-Vorgängerprogramme ...
Projects: LiSyM-Krebs Partnering, Forschungsnetzwerk LiSyM-Krebs, SMART-NAFLD, DEEP-HCC network, C-TIP-HCC network
Web page: https://www.lisym-cancer.org
LiSyM-Krebs ist ein nationales Forschungsnetz zur Früherkennung und Prävention von Leberkrebs, das unter Verwendung des systemmedizinischen Forschungsansatzes die komplexen, dynamischen Prozesse der Krankheitsprogression analysiert, um ausgehend von den Erkenntnissen aus dem Forschungsnetz LiSyM die Entstehung von Leberkrebs besser zu verstehen, vorherzusagen und im besten Fall sogar zu verhindern. LiSyM-Krebs setzt die erfolgreichen Forschungsaktivitäten der BMBF-Vorgängerprogramme ...
Projects: LiSyM-Krebs Partnering, Forschungsnetzwerk LiSyM-Krebs, SMART-NAFLD, DEEP-HCC network, C-TIP-HCC network
Web page: https://www.lisym-cancer.org
LiSyM-Krebs ist ein nationales Forschungsnetz zur Früherkennung und Prävention von Leberkrebs, das unter Verwendung des systemmedizinischen Forschungsansatzes die komplexen, dynamischen Prozesse der Krankheitsprogression analysiert, um ausgehend von den Erkenntnissen aus dem Forschungsnetz LiSyM die Entstehung von Leberkrebs besser zu verstehen, vorherzusagen und im besten Fall sogar zu verhindern. LiSyM-Krebs setzt die erfolgreichen Forschungsaktivitäten der BMBF-Vorgängerprogramme ...
Projects: LiSyM-Krebs Partnering, Forschungsnetzwerk LiSyM-Krebs, SMART-NAFLD, DEEP-HCC network, C-TIP-HCC network
Web page: https://www.lisym-cancer.org
LiSyM-Krebs ist ein nationales Forschungsnetz zur Früherkennung und Prävention von Leberkrebs, das unter Verwendung des systemmedizinischen Forschungsansatzes die komplexen, dynamischen Prozesse der Krankheitsprogression analysiert, um ausgehend von den Erkenntnissen aus dem Forschungsnetz LiSyM die Entstehung von Leberkrebs besser zu verstehen, vorherzusagen und im besten Fall sogar zu verhindern. LiSyM-Krebs setzt die erfolgreichen Forschungsaktivitäten der BMBF-Vorgängerprogramme ...
Projects: LiSyM-Krebs Partnering, Forschungsnetzwerk LiSyM-Krebs, SMART-NAFLD, DEEP-HCC network, C-TIP-HCC network
Web page: https://www.lisym-cancer.org
Liver Systems Medicine : striving to develop non-invasive methods for diagnosing and treating NAFLD by combining mathematical modeling and biological research. LiSyM, is a multidisciplinary research network, in which molecular and cell biologists, clinical researchers, pharmacologists and experts in mathematical modeling examine the liver in its entirety. LiSyM research focuses on the metabolic liver disease non-alcoholic fatty liver disease (NAFLD), which includes non-alcoholic steatohepatitis ...
Projects: LiSyM Core Infrastructure and Management (LiSyM-PD), LiSyM Pillar I: Early Metabolic Injury (LiSyM-EMI), LiSyM Pillar II: Chronic Liver Disease Progression (LiSyM-DP), LiSyM Pillar III: Regeneration and Repair in Acute-on-Chronic Liver Failure (LiSyM-ACLF), LiSyM Pillar IV: Liver Function Diagnostics (LiSyM-LiFuDi), Model Guided Pharmacotherapy In Chronic Liver Disease (LiSyM-MGP), Molecular Steatosis - Imaging & Modeling (LiSyM-MSIM), The Hedgehog Signalling Pathway (LiSyM-JGMMS), Multi-Scale Models for Personalized Liver Function Tests (LiSyM-MM-PLF), LiSyM PALs, Project Management PTJ, LiSyM network, LiSyM Scientific Leadership Team (LiSyM-LT)
Web page: https://www.lisym.org/
Dr. Nachiket Vartak (TU University, Dortmund) investigates the role of a particular protein - the GTPase Rab18 - in initiating NAFLD. He tries to influence Rab18 pharmacologically so that NAFLD is not initiated. Vartak also analyzes how bile acids leave the liver. He hopes to find ways to improve the flow of bile in a liver with dysfunctional bile flow.
Programme: LiSyM: Liver Systems Medicine
Public web page: http://www.lisym.org/our-work/junior-group/the-protein-rab18
Start date: 1st Jan 2016
Organisms: Homo sapiens, Mus musculus
One of the tasks of the healthy liver is to store fat. Yet, at some stage, too much fat makes the liver sick. One critical time point occurs when a healthy fatty liver becomes inflamed and progresses to steatohepatitis, or NASH. LiSyM-Pillar I will identify what events lead to this transition. Does it occur in all parts of the liver? Which molecules indicate that it is taking place? Can the degeneration be stopped or undone - and if so, how?
Programme: LiSyM: Liver Systems Medicine
Public web page: http://www.lisym.org/our-work/pillar-research/zones-of-the-liver
Start date: 1st Jan 2016
Organisms: Mus musculus, Rattus rattus, Rattus norvegicus, Homo sapiens
Dr. Madlen Matz-Soja (University of Leipzig) investigates the importance of a control mechanism - the hedgehog signaling pathway - for fatty liver disease. She has shown that the signaling pathway directs how liver cells in NAFLD accumulate fat. Hedgehog also affects sex hormones in the liver. Therefore, Matz-Soya hopes to clarify why women and men suffer from cirrhosis and liver cancer with varying degrees of frequency.
Programme: LiSyM: Liver Systems Medicine
Public web page: http://www.lisym.org/our-work/junior-group/hedgehog-influences
Start date: 1st Jan 2016
Organisms: Homo sapiens, Mus musculus
Dr. Ahmed Ghallab (TU University, Dortmund) deals with chronic liver damage caused by toxins. In addition, he investigates processes associated with cholestasis - when bile accumulates in the bile ducts. Ghallab has been able to explain basic mechanisms of acute cholestasis, using a method for intravital two-photon microscopy, which he developed.
Programme: LiSyM: Liver Systems Medicine
Public web page: http://www.lisym.org/our-work/junior-group/the-liver-protects-itself
Start date: 1st Jan 2016
Organisms: Homo sapiens, Mus musculus
Forschungsnetzwerk zur Früherkennung und Prävention- LiSyM-Krebs
Ein Netzwerk von Klinikern, Wissenschaftlern und Datenmanagern hat sich zur Aufgabe gemacht, Methoden zu entwickeln, um Patienten mit einem hohen Risiko für ein Leberkarzinom frühzeitig, in Vorstadien der Tumorentwicklung, identifizieren zu können. Gemeinsam bilden sie das „Systemmedizinische Forschungsnetzwerk zur Früherkennung und Prävention von Leberkrebs“, LiSym-Krebs, das vom Bundesministerium für Bildung und Forschung ...
Programme: LiSyM-Krebs - Systemmedizinisches Forschungsnetz zur Früherkennung und Prävention von Leberkrebs
Public web page: Not specified
Organisms: Homo sapiens, Mus musculus, Rattus norvegicus, Rattus rattus
Submitter: Seddik Hammad
Assay type: Proteomics
Technology type: FACS
Investigation: Julia/Yan
Study: CCl4 Treatment in mice
Organisms: Mus musculus
SOPs: Sample Collection and Preservation of Blood and...
Data files: Movies for quantification, SAC mice RNA microarray, Supp MM 1, Supp fig 3, Supp fig1, Supp fig2, Supplemental Table 1:, Supplemental Table 2, Supplmentary Materials, Methods, Figures and Ta... and 1 hidden item
Snapshots: No snapshots
not yet calibrated, not yet reduced
Creators: Daniel Lill, Viktor Makarenko
Submitter: Daniel Lill
Model type: Ordinary differential equations (ODE)
Model format: SBML
Environment: Not specified
Model for the interaction of Wnt and Hh as published in Kolbe et al.: Mutual Zonated Interactions of Wnt and Hh Signaling Are Orchestrating the Metabolism of the Adult Liver in Mice and Human, Cell Reports, 29,4553,
Creators: Michael Kücken, Lutz Brusch
Submitters: Lutz Brusch, Michael Kücken
Model type: Partial differential equations (PDE)
Model format: MorpheusML
Environment: Morpheus
For the spatio-temporal dynamics of bile transport, bile canalicular dilation, mechanical stimulation and transduction of YAP signaling during liver regeneration see the open access publication and its appendix: Meyer et al. (2020) Bile canaliculi remodeling activates YAP via the actin cytoskeleton during liver regeneration. Molecular Systems Biology 16:e8985. https://doi.org/10.15252/msb.20198985
The model format is MorpheusML that can readily be loaded and run in the free and open source software ...
Creator: Lutz Brusch
Submitter: Lutz Brusch
Model type: Agent based modelling
Model format: MorpheusML
Environment: Morpheus
Abstract (Expand)
Authors: E. Alamoudi, Y. Schalte, R. Muller, J. Starruss, N. Bundgaard, F. Graw, L. Brusch, J. Hasenauer
Date Published: 1st Nov 2023
Publication Type: Journal
PubMed ID: 37947308
Citation: Bioinformatics. 2023 Nov 1;39(11):btad674. doi: 10.1093/bioinformatics/btad674.
Abstract (Expand)
Authors: Emad Alamoudi, Yannik Schälte, Robert Müller, Jörn Starruß, Nils Bundgaard, Frederik Graw, Lutz Brusch, Jan Hasenauer
Date Published: 21st Feb 2023
Publication Type: Misc
DOI: 10.1101/2023.02.21.528946
Citation: biorxiv;2023.02.21.528946v2,[Preprint]
Abstract (Expand)
Authors: Kirstin Meyer, Hernan Morales‐Navarrete, Sarah Seifert, Michaela Wilsch‐Braeuninger, Uta Dahmen, Elly M Tanaka, Lutz Brusch, Yannis Kalaidzidis, Marino Zerial
Date Published: 24th Feb 2020
Publication Type: Not specified
Citation: Mol Syst Biol 16(2) : 186
Abstract (Expand)
Authors: Erik Kolbe, Susanne Aleithe, Christiane Rennert, Luise Spormann, Fritzi Ott, David Meierhofer, Robert Gajowski, Claus Stöpel, Stefan Hoehme, Michael Kücken, Lutz Brusch, Michael Seifert, Witigo von Schoenfels, Clemens Schafmayer, Mario Brosch, Ute Hofmann, Georg Damm, Daniel Seehofer, Jochen Hampe, Rolf Gebhardt, Madlen Matz-Soja
Date Published: 1st Dec 2019
Publication Type: Not specified
DOI: 10.1016/j.celrep.2019.11.104
Citation: Cell Reports 29(13) : 4553